神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
我就一个死宅，为什么来到了这个可怕的玄幻世界？！哈哈，可惜我是无敌的。
九千年前，仙武帝尊率领百万神将打入太古洪荒，却无一人归来，只有一缕真火遗留世间。九千年后，门派废徒叶辰，被赶出宗门，无以为家，机缘巧合之下偶得真火，再踏仙武之路。这是一个神魔仙佛并立的世界，这是一个诸天万域混乱的年代，叶辰的逆天征途，由此开始。
超变战陀是风靡世界的全新陀螺竞技运动！通过将超能环叠加在主陀螺上，超变战陀就能瞬间爆发出奇迹般的爆速能量。为了追求最强“战陀王”的称号，世界各地的陀螺选手都汇聚在战陀学院，上演着热血沸腾的陀螺对决！左旋PK右旋，开启最强决斗！！！一起来战斗吧！
异世界帕拉尼来袭，和平的拉贝尔遭到攻击。在入侵者伊赛德斯的强攻下，守护拉贝尔的节气守护结界被打破，二十四节气散落失踪。为了拯救拉贝尔，同时也为了解除帕拉尼的黑暗危机，新一代的花仙魔法使者雪城爱与帕拉尼王子埃里克一起，来到地球，收复散落的节气花信。
卡修斯和无尽能源都被布莱克精灵夺走，罗杰船长下令找到布莱克，夺回无尽能源……
