故事舞台是在机动战士高达中的一年战争终结后七年。战争结束后一部份吉恩公国军事势力并未降伏继续在各地与地球联邦军发生军事冲突，因此地球联邦军内部强力主张追杀吉恩残余份子的激进排他势力泰坦斯（Titans）结成。由于泰坦斯对宇宙住民的强硬血腥镇压的手段，反势力奥干A.E.U.G.(台湾翻译为奥干，港译为奥古)结成。故事的开始于宇宙世纪0087年（U.C. 0087），前半主要围绕奥干和泰坦斯两派系的对抗，中段吉恩残余份子上阿克西斯(港译为阿古捷斯)登场，与奥干、泰坦斯角力周周旋，展开激战。
1989年，日本。 乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发前往DIO的所在地——埃及。
人类创作了许许多多的故事。 喜悦、悲伤、愤怒、感动。这些引人入胜的故事撼动着人们的心灵。 但是，那些不过是作为旁观者的感想罢了。 如果，故事中的登场人物们拥有了“意志”。那么对于他们来说，创作出故事的我们，是神一般的存在吗？ ——在我等的世界内发起变革。 ——对诸神之地进行制裁。 任何人，都将成为“创造主(Creator)”。
东京郊外的街道——天鹅绒町，这里有着被剧团成员们称之为天鹅绒之路的圣地。身为原舞台演员、因一纸来信而站在此地的你，将会遇到的是……负债累累！没有客人！团员只有一位！失去过去辉煌即将倒闭的落魄剧团！因机缘巧合，你成为了剧团的团长兼【总监督】，身负把剧团重整起来的重任？
“為せ 汝の欲することを” かつて世界を救った英雄達がいた。 数多の英雄達は〈破壊〉の力と戦い、 この世界を守ったのだ。 そして、時は流れ―― 英雄たちは歴史の彼方へと去り、 彼らの力を身に纏い戦う〈継承者〉と呼ばれる 少年少女達に世界の運命は託されることとなった。 〈継承者〉の頂点に立つ〈セブンナイツ〉の一人、 少女ファリアは押し寄せる〈破壊〉の軍勢との戦いの中、 ネモと名乗る一人の少年を救う。 激戦の中、 ネモは自らも知らぬままに〈英雄〉の力を喚起し、 〈継承者〉としての力を振るう。 だが、彼の〈英雄〉は 誰も知らぬ、誰も語らぬ者だった。 そしてこの時より始まるのだ。 過去と現在の交錯する魂の旅路が――
十二岁的神山满月（绪方惠美 配音）和外婆相依为命，酷爱唱歌的她却由于喉部的癌症而被外婆严令禁止歌唱。满月和幼年玩伴英知（木村良平 配音）有着约定，为了完成约定，满月向着成为歌手的道路上努力前进。某一日，一个名为“香葱拉面”的组合出现在了满月的满前，他们自称见习死神拓人（斋藤恭央 配音）和由依（本多知惠子 配音），他们告诉满月，她只剩下一年的寿命，而只要拿到她的灵魂，拓人即可成为正式的死神。伤心的满月感动了由依，他们决定帮助满月在死前达成她最后的心愿。 由依将满月的外表变成了十六岁的少女，这样她才够资格参加歌唱大赛。没想到，满月以“FULLMOON”的艺名一举获得成功，而在此过程中，拓人对满月的感情也渐渐变得复杂起来。英知的归来让拓人颇受打击，而拓人遗失已久的记忆也将成为威胁到拓人生死存亡的关键。
