Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。 （有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
性格有些孤僻喜爱安静的大学三年级生，樱井真一。总是被小一届，同高中毕业的学妹宇崎花，以各种照顾爱耍孤僻的学长的名义为由，进行各种无厘头的纠缠。虽然一开始觉得有点困扰，但却逐渐习惯起来……
经常被同学欺凌的南云始，与同班同学一起被召唤到了异世界。与接连着发现了自己的那作弊般的能力的同班同学们相反的是，始却得到了炼成师这个平凡职业。即使在异世界也是最弱的他，被某个同班同学陷害后掉进了迷宫的深处——！？ 就在找不到逃脱方法而陷入了绝望深渊的始，凭借着炼成师这个职业踏上了通往最强的道路，并与吸血鬼·月相遇了——。 “我保护月，月保护我，这样的话我们就是最强了。让我们一起横扫一切直至超越整个世界吧。” 迷宫深处的少年与在那里的吸血鬼之间的“最强”异世界幻想曲，开幕！ ——然后，少年超越了“最强”。
要成为我的家人吗？——还有，不想更加脸红心跳吗？ 被“母亲病危”这一消息所骗而被迫来到海外的高中生海棠晴，在那里突然被人介绍了一位被说是“这是你的弟弟！”的男孩子零。晴拼命地照顾着野生状态又不听别人的话的零，但零的出生似乎存在着某些秘密。之后，当零总算要和自己变得亲近的时候，晴遭遇了某起悲剧。 ——5年后，晴与在东京成长的零再会，但……？
改编自白石定规原作的同名轻小说，讲述了虽然年纪轻轻，但已经成为魔法使的最高阶的“魔女”的才女伊蕾娜，作为旅人在全世界自由旅行的故事。
在计算机宅男阿学遭到混混纠缠时，出手救了他的是隔壁班素昧平生的阿阳。脑子动得快、八面玲珑、做坏事却不懂得踩剎车的阿阳，与有着沟通障碍、计算机知识却非常丰富的阿学，两人就此结下不解之缘，成为互补的最强搭档。毕业后，两人决定白手起家创业，一起赚到能买到世界上任何想要东西的「一兆美元」！为此，他们决定挑战世界级黑客大赛SECCHAM……！
