这个星球上生活着不可思议的生物神奇宝贝。现在开始讲述少年小智和神奇宝贝们的相遇、冒险和战斗经历的故事。 在结束了在成都地区的旅行后 小智只带上了他最先获得的神奇宝贝——皮卡丘 来到了芳缘地方。但是在到芳缘地方的途中，皮卡丘被火箭队的攻击变得异常奇怪... 在AG中，小智和新加入的女主角——小遥，永远支持着小智的小刚，以及小遥的弟弟小胜，一起在芳缘地方，以及到对战开拓区旅行
他们拥有梦想。 总有一天，飞向广阔天空的梦想。 知晓被玻璃遮盖的这片天空有多么遥远。 遥远的未来。 人类在荒废的大地上建设了移动要塞都市“种植园”，并讴歌着文明。 在那当中建造的驾驶员居住设施“米斯特汀”，通称“鸟笼”。 孩子们就住在那里。 对外面的世界一无所知。 对自由的天空一无所知。 他们被告知的使命，只有战斗而已。 敌人是一切都被谜团覆盖的巨大生命体“叫龙”。 为了对抗尚未见过的敌人，孩子们乘上被称为“FRANXX”的机器人。 他们坚信，乘坐其中，就是对自己存在的证明。 有一位曾被称作神童的少年。 代号016。名字是广。 但他现在却跌落谷底。 是不被人需要的存在。 如果没有乘上FRANXX，就如同不存在一样。 在这样的广面前，某天，一位被称作02的神秘少女出现了。 她的额头，长着两根艳丽的角。 “——找到了哦，我的DARLING”
布兰登和哈利是平民窟里混大的哥们儿，勾肩搭背成了无数小混混中的典型——心比天高，以为凭着年轻和不怕死可以把整个世界都踩在脚下。然而真正的上位者略动动小指，他们的世界已是天崩地裂。两人失去了一切有被逼入死地，当有了绝境逢生的机会，哈利迫不及待的加入了黑手党，他再也不要过落水狗一般的生活。布兰登只是犹豫了一下便跟定了他——他们已经习惯了是福是祸一起分担。布兰登深收黑帮老大Big Daddy的喜爱。成了组织的最强杀手。而哈利为了自由支配和给予权利，用尽手段不断往上爬，成为了组织的“背叛者”，成为了布兰登的清除对象……而布兰登下不了手，他的心还是当年那个黑发少年。可哈利不是了，他要先下手为强，他不能容忍任何阻挡自己往上爬的道路……<BR> 十几年后，一个迷一样的老人，一个另人恐惧的孤傲杀手，一个被组织追杀的少女！对于两手携带着枪的“凯烙贝烙司”，背起肩上装在巨大棺材里的重火力枪械，再次踏上旅途的“Beyond The Grave” 这次敌人的真目的是！？他的目的是——必须破坏一切，响起枪击的交响曲。
圣杯是传说中可实现持有者一切愿望的宝物。而为了得到圣杯的仪式就被称为圣杯战争。 参加圣杯战争的7名由圣杯选出的魔术师被称为Master，与7名被称为Servant的使魔订定契约。他们是由圣杯选择的七位英灵，被分为七个职阶，以使魔的身份被召唤出来。能获得圣杯的只有一组，这7组人马各自为了成为最后的那一组而互相残杀。 卫宫切嗣的养子卫宫士郎，偶然地与servant中的剑士Saber（セイバー）订定契约，被卷入圣杯战争当中...
