《科学小飞侠》这部动画的原作是吉田龙夫（漫画家出身，后来投入动画制作而成立龙之子制作，已故），由鸟海尽三与陶山智负责企划。本片当初是以与巨大机械战斗的低年龄向动作片为起点，但在导入公害、科学、战争等现实中的严肃题材，与亲情及角色过去的戏剧性，这些非儿童导向的故事都博得好评，因而得以将预定的一年播映期延长，并成为龙之子制作的SF英雄动画类型经典代表作。
冈崎由真（加隈亚衣 配音）是一个性格非常单纯的可爱女孩，正在同名叫武田（逢坂良太 配音）的男生交往。对于爱情一窍不通的由真常常会因为武田的热情而感到不知所措，因此总是和自己的青梅竹马水科萤（五十岚裕美 配音）商量。于是，萤开始了对由真的“爱情特训”，在练习中，两人难免会有些肢体上的亲密举动，让由真没有想到的是，自己的内心竟然会因为萤的触碰而小鹿乱撞。 水科萤也有着在交往的额男友藤原（小野大辅 配音），藤原虽然看上去漠视一切，但实际上格外的敏感，他渐渐意识到了女朋友对于由真的异样的感情。
作为春名露（池泽春菜 配音）的宠物，哈姆太郎（间宫久留美 配音）是一只外表可爱内心单纯又充满着好奇心的黄金鼠，虽然和主人之间无法用语言交流，但两人深厚的感情溢于言表。这一次，哈姆太郎跟随着主人来到了一座新的城市，对于哈姆太郎来说，这无疑是一场为大冒险的开端。 在新家里，哈姆太郎结识了许多有趣的朋友。来自法国的丽丽（村井每早 配音）似乎对哈姆太郎有着爱慕的感情；野生的大将（伊藤健太郎）总是充当着首领的角色；贪吃又可爱的哆哆（爱河里花子 配音）依旧捧着它的葵花籽。越来越多的朋友加入了哈姆太郎的大家庭，它们建立的哈姆哈之树更是成为了大家欢聚一堂的据点。有了这些朋友的陪伴，哈姆太郎快乐的生活开始了。
小说第9卷限定版附OVA。
