《果宝特攻3》讲述了 菠萝吹雪 偶然间穿越到了 古代 的水果世界。古代水果尚未经过培植改良，都是野果， 菠萝吹雪 从他们身上学习到中华兵法及古代书画，立志成为为民除害的 英雄 。 菠萝吹雪 开始修复时光机的 旅程 ，竟然遇到了水果伙伴们的 祖先 ，最后帮助他们打败了 火龙果 ，并顺利回到 现代 。
罗峰为了能够守护地球前往血洛大陆进行试炼，在这片大陆上他不断突破自我，结识了友善的朋友也遇到了强大的敌人，但是他都没有退缩，而是一步一个脚印的负重前行。最终他完成了无限的进阶，获得了保护地球的强大能力。
经历了两个冒险事件的吴邪从南沙回到杭州后，在修养期间，突然接到了久未谋面的发小老痒的电话。老痒和吴邪讲述了自己三年前在秦岭山腹地的冒险见闻，并邀请吴邪一同前去冒险，再探上古遗迹。吴邪和老痒出发前往了秦岭山脉探险，在这里，他们见到了巨大的哲罗鲑、壮丽的地下河瀑布、不可思议的上古神树…而一直神出鬼没的张起灵，竟也在暗中帮助着吴邪。
普通待业青年郝仁在找工作时，阴差阳错成为了希灵帝国女神渡鸦12345的审查官，负责处理地球中各种异类事件，本以为自己的任务就是打打酱油，照顾好异类租客，偶尔出去维护下世界和平。没想到这一次……搞大了！！……一阵鸡飞狗跳后，以为终于能安定下来好好过个年，但…真会如他所愿吗？
猪猪侠赶在黄金赛前回到修修镇，遇见强敌电狐的搭档前来踢馆，虽然猪猪侠与星航应战险胜，但正式开赛后，超星车队在电狐面前节节败退。同时，芸芸意外结识了南大陆最强车手火虎并向其学习完美跑法，新的跑法导致芸芸和星航在赛场上难以配合，车队陷入低迷。超星车队能否重拾默契，成功打破“三杰俱乐部”的赛场垄断？一段超越对手、超越自我的成长之旅即将开始。
