自从王陆以灵剑派仙人为目标展开修行已经过了两年的岁月。他被赋予了“降临下界与俗世接触”的试炼，并前往自己出生的故乡。
恐龙战队再度与复仇归来的掌控者及其制造的魔方怪物们斗智斗勇，全力保护恐龙城市的故事。在愈发艰难的战斗过程中，恐龙战队成员们在新伙伴冰凝的技术支持下，运用魔方手表陆续召唤出了全新的数码恐龙和电磁恐龙，靠着智慧与谋略和不屈不挠的精神，成功击败了掌控者及其怪物军团，维持了社会的秩序，恢复了城市的安宁。
炎部落一战之后，延羽、嘉静、凌义、基洛、希阳五人回到金波城，这时却突然收到土元素城市——沙砾市受到邪灵组织入侵的消息，五人立刻赶往沙砾市，却发现这里出现了五个冒充机甲五勇士的人，原来这些人冒充延羽五人是为了从沙砾市酋长口中得出沙砾市能源石——灵土矿石的位置。最后在延羽五人的努力之下，终于揭发了假五人组的身份，与此同时，却让邪灵得知了灵土矿石散落在地下的秘密！
