雅典娜的哥哥，传说中的太阳神亚伯复活，受众神之命在地上世界引发大洪水来达到肃清人类的企图。身为雅典娜的纱织打算阻止亚伯，反被亚伯杀死，灵魂坠入死之国度。为了拯救雅典娜，星矢等人潜入了圣域的禁地“Dignity Hill”，面前却被在十二宫之战中战死的撒加等黄金圣斗士以及从神话时代开始就守护亚伯的“日冕圣斗士（Corona Saint）”所阻挡。面对以往从未遇到过的强敌，星矢等人最大的激战展开！
冰河在西伯利亚冰原上救了被神秘士兵袭击的赤须士兵后，从他口中打听出众神的激战将在名为“阿斯格特”的地方开始，于是便前往北欧阿斯格特调查。追随着冰河的纱织和星矢等人也前往阿斯格特，但断绝了冰河的消息，而阿斯格特的多鲁巴鲁教主则企图支配圣域。纱织更被多鲁巴鲁的魔爪封印入异次元。星矢等人前往拯救纱织的时候，面前被阿斯格特的战士·神斗士所阻挡。在神之国的壮绝激斗随之展开。
