有对喜欢在世界各地飞来飞去旅行的父母和一个有流浪癖的姐姐，独自生活的二之宫峻护某天却被一对诡异的兄妹缠上，只说是“从今天开始关照了”，便被迫进行同居生活。而这两人身上有着重大的秘密。据说哥哥－月村美树彦和妹妹－月村真由，都是需要别人的精气才能活下去的特异体质。但因为峻护的姐姐－二之宫凉子和美树彦是故知的关系，完全无视峻护的意见，而开始了他们的共同生活。又因为真由有严重的男性恐惧症，为了帮助她克服这个毛病，在凉子和美树彦的无视下，峻护担当起了“护花使者”的重任。再加上峻护和真由所就读的学校的学生会长－北条丽华，他们之间的三角关系便开始发展……。
总北高中自行车竞技部所属的一年级生·小野田坂道，与同年级的今泉俊辅和鸣子章吉、三年级的金城真护、卷岛裕介、田所迅一同以“Team总北”的身份在全国大赛中出场。他们突破了与王者·箱根学园以及京都伏见等对手学校的激烈比赛，漂亮地获得了综合优胜。那样炎热的夏天也已过去，三年生即将引退，总北以“新世代”的队伍在全国大赛中连霸为目标，终于开始进发！
混杂于群众之中，以人类的肉为食。拥有人类的形态，却与人类不同的存在……“喰种”。 在对“喰种”进行驱逐、研究的“CCG”，曾经率领“Quinx”小组的喰种搜查官“佐佐木琲世”。他正是行踪不明的眼罩喰种“金木研”。 另一方面，在成立了新体制的“CCG”，以旧多二福为中心，不安定的行动终于表面化…… 与“金木研”有关的故事，终于迈向最终章——。
