《鹡鸰女神2》：来，开始吧新的神话，可爱的战记，奇迹般的恋爱故事..................2020年，在新东帝都耸立的高楼屋顶上，一个男人发出了这样的宣言。那是整个“鹡鸰计划”开始的信号.被称为“鹡鸰”的108名可爱战士，为了寻找各自的主・葦牙，被放飞到人类世界睹上自己的信念，为了成为最后一只“鹡鸰”.“对不起，今年也失败了……”虽然来到了憧憬已久的东京，但是考大学失败，成为复读生的佐桥皆人。整天无所事事，也没什么亲密朋友，当然也不可能会有女朋友，是个所谓的心力交瘁者。而且在那一天，决定要第二次复读。在残酷的现实世界，情绪低落的皆人走在回家的路上。在他的面前，突然，一个美少女从天而降。她的名字是“结”。自称名叫“鹡鸰”的少女，选择皆人作为命运的对象“葦牙”。“我，为了大家而战斗！”皆人与结的羁绊，故事由此展开——这是，人与鹡鸰交织而成的一出新神话这是，由鹡鸰们展开的一场可爱的战记这是，与命运之人一起纺织而出的奇迹爱情故事“所有的一切，都是为了与所爱的人永远的结合......................
拯救将近毁灭的世界不是一件简单的任务。因此，当城之内获得了四人的异国旅行的机会，游戏和他的朋友决定要珍惜这次难得的旅行，大概他们是这么认为的吧！在到达他们的目的地之前，他们的飞机失事，他们到了一个荒芜人烟的森林，遇见了神秘的 Dr. Alex Brisbane。Dr. Alex Brisbane惊奇地发现了，距离埃非常悠远的这个地方，有一个秘密的金字塔，通往另一个世界，胶囊怪兽的世界。 当游戏和他的朋友进入这个金字塔的时候，他们魔法传送到远古生物居住的危险王国，他们在一个神秘的迷宫中迷路,为了要找到通道回家,作了许多试验。 当游戏在生命危险的时候，他把的决斗盘换为 Capsule Shooter，一场生死决斗开始
原本期望能成为魔法少女的女主柊舞缇娜，某天突然遇到像吉祥物的生物，获得能变成邪恶组织女干部的能力，并与原本憧憬的魔法少女们对抗。
