某科学的一方通行

工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！

小学生木之本樱（丹下樱 配音）是一个平凡的女孩，有一个温柔的爸爸木之本藤隆（田中秀幸 配音）和一个体贴的好友大道寺知世（岩男润子 配音）。一天，在父亲的书房中她发现了一本尘封已久的魔法书，并无意间解除了书上的封印，一只会说话的玩偶可鲁贝洛斯（久川绫 配音）出现在了她的面前。小可告诉她，自己是守护这本书的神兽，书中封印着名叫库洛牌的东西。现在，封印解除了，它要小樱成为库洛魔法师，它将协助她收复这些四处捣乱的库洛牌。隔天，小樱的班上转来了一个名叫李小狼（熊井素子 配音）的转学生，这个外表酷酷的男孩原来也是冲着库洛牌而来。                                                                      　　随着库洛牌的封印，越来越多的角色出现在了小樱的身边，而他们的真正目的，却还不得而知。

大部分的人类，在这个时代里都拥有名为“个性”的力量，但有力量之人却不一定都属于正义的一方。                                                                      　　只要邪恶出现的地方，必定会有英雄挺身而出拯救众人。                                                                      　　一名天生没有力量的少年——绿谷出久从小就憧憬一位顶尖英雄，而他的梦想就是成为伟大的英雄，                                                                      　　可是，没有力量的他能实现自己的梦想吗？                                                                      　　虽然困难重重，少年却依旧不放弃，朝着自己的目标勇往前进！

　　不死之身的吸血鬼为何遭到杀害？
　　「鸟笼使者」──那就是专查怪物案件的侦探。
　　吸血鬼及人造人、怪盗、狼人、开膛手，还有名侦探。异形蠢动的十九世纪末欧洲，人类亲和派的吸血鬼遭到银桩贯穿虐杀死亡。找来解决此案的，是专门处理人类避之唯恐不及的「怪物案件」的专门侦探轮堂鸦夜，以及带着奇怪鸟笼的男人真打津轻。他们从留存的线索和怪物才具备的特性导出推理。充满谜团宛如噩梦的笑剧，在此开幕！