《萌鸡小队》讲述了四只萌鸡宝宝在妈妈的关爱下，与其他小动物一同快乐相处，共同成长的故事。在遥远的大森林里，有一棵美丽的大树，大树底下被弹性十足的蘑菇和争奇斗艳的花朵包围着，形成了一个宽阔的大自然游乐场，这就是萌鸡们的家。萌鸡妈妈美佳开明又热心，四只萌鸡宝宝（大哥大宇、二姐朵朵、三哥欢欢、小弟麦奇）活泼又可爱。他们互相帮助，四处探险，还结交了很多新朋友，共同描绘出一幅清新童趣的森林画卷，让小朋友们在领略大自然的奥妙的同时，也在萌鸡身上学到许多美好品质。
公元607年，当朝皇帝残暴无道、民不聊生，正值最黑暗的时代。 身手不凡的镖客刀马行走于西域大漠，在躲避朝廷追杀的途中，他接下了一个目的地为长安的护送任务，本以为只是一趟简单的护镖，却没想到一路危机起伏，险象环生。
基因石被毁，不料基因石能量逸出，飘散到地球各处，引发了异常现象，故事从变形机甲、机甲兽和变异战士三方之间的斗争展开。
主角柯奇是一个真诚善良，但性格有些冲动的玩具机器人。在危急时刻，他遇到了另一群玩具——聪慧的黑包子、沉稳的刀剑客、热心的小骨头、勇敢的点点、机智的嗦发。在他们共同帮助下，柯奇很快融入了友爱的玩具之家。好景不长，玩具之家被老鼠皮条破坏，大家不知该何去何从。这时，黑包子告诉大家，玩具城城主托雷能为玩具们实现任何愿望。于是众人决定结伴前往托雷玩具城。
