本作的故事源于一个都市传说，据闻如果能够收集齐被称为“Platonic Heart”的宝石就能实现任何愿望，但只有被选中之人有资格参加宝石的争夺战，而当中也充满着各种谜团，本作一共有11名主要女性角色，主人公清纯女学院2年级生的伊势岛绫就是其中一人，她们的任务就是要夺回宝石，故事基本在这样的模式下展开。
时间进入21世纪，科技高度发达，人类已经发明出可以自由穿梭时空的时光机。在时空条例的管辖下，人们尽量不去打扰古人的生活，以免引起历史改变。 21世纪某天，地球遭到极热和极冷光束的袭击。为了探究原因，日本时空管理局派出训练有素的“时代战士”前往恐龙横行的白垩纪调查。在那里，他们遇见了来自格雷萨行星的阿尔塔夏公主（村野奈々美 饰）及其随从机器人吉伊。从公主口中，他们得知邪恶的格得密斯星人四处侵略，为了追杀公主千里迢迢来到地球，更意图毁灭人类。为了保护白垩纪的恐龙和地球，时代战士与入侵者展开连番大战。其中，格乌（大西徹也 饰）化身的超级战士克塞更是格得密斯星人最强劲的对手。不断升级的正邪之战，在遥远的白垩纪展开……
故事发生于东京，在全球最大体育盛事WSG即将召开之际，知名企业的高官却接连在赞助商酒会现场遭到绑架，而自新名古屋站至东京的最高时速1000km的真空超导磁悬浮列车也被卷入其中，一场牵动国际目光的重大案件就此展开。
随心所欲过着独居生活的男子高中生龙己，在某天帮助了倒在河川旁美青年若狭，但没想到的是他竟然是一条人鱼，而且很喜欢龙己家里的浴室的他决定在那儿定居。就这样，有点任性可爱、寄食的若狭与冷漠但又助人为乐的龙己的同居生活正式开演。
『Re:ゼロから始める休憩時間』（リ・ゼロからはじめるブレイクタイム）および『Re:ぷち Re:プチから始める異世界生活』（りぷち）は、AT-Xで本編終了後に放送された短編アニメ。『Re:ゼロから始める休憩時間』は本編で尺や展開の都合から触れることのできなかった事柄や設定を補足する内容が多い。『Re:ぷち』は本編とは関係がないスピンオフアニメとなる。
