故事主要讲述出身昆仑星的少年术师缇可只身携带龙图来到地球，希望收服24节气守护灵，挽救故乡的危机。阴差阳错之下，龙图落到地球小男孩夏天手里，并承认其为主人。在收服守护灵的过程中，形形色色或敌或友的角色纷纷登场。缇可、夏天结识了众多朋友，也遭遇了重重挫折，同时，隐藏在龙图之中的惊人真相开始逐渐显现。
整个宇宙分为域内宇宙和域外宇宙，两个宇宙彼此为敌，域外宇宙由天魔统治，域内宇宙分为神界，仙界，凡间。 在宇宙中，像天罚大陆这样的凡间位面，数不胜数，其统称为：九天星域。九天星域中，九大仙帝统领九重之中所有星域。九天之上，乃炼仙神域，仙人最终化神之路，必要通过炼仙神域，方能凝聚神格，成为神，到达神界。神界万族林立，各族之神极为强大。在遥远的过去，神界万族，被始源至尊、混沌至尊，还有鸿蒙至尊统领。三大至尊，三足鼎立，统管神界、九天仙界。 鸿蒙神界之主鸿蒙至尊，身份尊贵，属下众多，为神界最强之人，精通天下万术。彼
漠北当下表面平静，实则暗中涌动。王后述里朵正筹划一场大会，不良帅为探查漠北动向带着一众不良人出现在漠北，以降臣为首的四大尸祖在此期间也来到漠北开了家古董羹店，而神秘的杀人凶手更弄得人心惶惶，几方势力各怀心思....
基因石能量渐渐恢复成基因石，且显露出更强大的力量、更多不为人知的秘密。反派势必不会轻易罢休，将以更强大的姿态卷土重来。但在艰难的挑战中，普力士等人仍看到了希望：宇宙中，分散著为数不明的「变形联盟战士」，这群代表正义的首领勇士若聚集起来，将会成为一股巨流，一起勇敢地为守护地球而战！
故事延续第二季主线，灵界与斗魂卫在利益纠葛之下冲突不断，本季灵界派出强盛军队欲对斗魂卫赶尽杀绝，两方势力都在以正在举办门宗大会的五法山为中心汇集，在这里发生着惨烈的战斗与冲突。
讲述了SPT先锋小队在帕索尔星帮助麒麟夺回火之翼，麒麟告诉SPT先锋小队去巨石星卡图冈之门自然会找到无尽能源的答案，SPT先锋小队听了麒麟的话，去巨石星找卡图冈之门的事。战神联盟也将登场。盖亚的哥哥瑞尔斯以新形象和重要角色的身份再次登场，本季动画中将有许多新角色登场，麒麟、魔圣尤尼卡、海盗四魔将之一的吉约等新角色登场
