In a surreal world, a large maximum security prison, which houses thousands of dangerous inmates is run by an eccentric warden and his equally odd staff.
海格力斯（泰特·多诺万 Tate Donovan 配音）是宙斯（雷普·汤恩 Rip Torn 配音）的儿子，天生拥有神力，力大无穷。冥王哈迪斯（詹姆斯·伍兹 James Woods 配音）企图叛变，他将海格力斯视作最危险的敌人，于是借机将他贬为凡人，想就此将他消灭。 然而，哈迪斯的阴谋并没有伤害到海格力斯，尽管变成了凡人，但在他的身上依旧保留着神力，当他发现自己的真实身份和过往后，善良而富有正义感的海格力斯决定重返奥林帕斯山，然而这谈何容易。一次偶然中，大力神结识了名为梅佳拉（Susan Egan 配音）的美丽女子，可是梅佳拉的真实身份竟然是哈迪斯的手下，通往奥林帕斯山的道路充满了荆棘，海格力斯最终能够抵达目的地吗？
本剧的世界设定是普通人类和拟人化的动物共同生活在一起，除了外形，这些动物跟人类没什么不同。因饰演电影《一代骄马》，曾经的过气明星马男波杰克（威尔·阿奈特 Will Arnett 配音）重新回到大众视野，还有望角逐今年奥斯卡最佳男主角。在经纪人卡罗琳公主（艾米·塞德丽丝 Amy Sedaris 配音）和朋友戴安（爱丽森·布里 Alison Brie 配音）的帮助下，加上聘请了新的代理人，波杰克到处宣传电影，全力冲刺奥斯卡。过去浑浑噩噩的颓废生活，以及现在受人追捧令人瞩目的明星生活，形成鲜明对比。但是这一切，似乎并没有填补波杰克内心的空虚。
故事讲述两派来到地球后，因为发生了一些“事件”，导致双方外形大变（也解释了两系列风格不同的原因）。也由于这些“事件”，变形金刚要隐藏于人类社会之中。如何去平衡一切关系是擎天柱作为领袖将要面临的考验，本作品的标题也由此而来。 值得一提的是，本次两派领袖 擎天柱 和 威震天 的配音者是久违的梦幻组合：来自初代动画的 Peter Cullen 和 Frank meijubar.net Welker！他们在阔别电视版的变形金刚作品多年后，再次一起回来共演这双经典的死对头！
经过了十个世纪，大约在198X年的某一天，阿特姆施莱德在日本收养了义女唐井(恰巧是天狗施莱德小禄崎的直系血缘传人)，并传授了她有关忍者的一切，可能是考虑到地球科技的发展让他即将可能回到太空，所以他将唐井立为自己的继承人，并告诉了她自己是外星人的一切真相。随后跟随地球上其它逃亡阿特姆的消息，阿特姆施莱德转战来到了美国，并且很快拥有了纽约市长颁发的城市金钥匙，成为纽约最大的资产家，家财万贯，同时拥有全市最高的大厦，并且控制着整个城市的黑势力。 同一时间里施莱德残忍的杀害了身在美国的守护者滨户良大师，所谓守护者是地球上崇拜并保护阿特姆流亡者的战士，因为滨户良在此之前曾经几次请求讨伐过天狗施莱德的五龙忍者裁判所帮忙打败这名阿特姆施莱德，但是裁判所表示他们只关心被封印起来的天狗，认为这是施莱德个冒牌货，所以没有必要与其一般见识。这一情况惹恼了阿特姆施莱德，之后因为朋友的背叛，滨户良随阿特姆流亡者们转移逃离了日本，但终究还是在美国被杀害了。 侥幸逃脱的滨户良的宠物鼠斯普林特意外的与另外四只乌龟在纽约下水道沾染上了由阿特姆所制作的变异液体，变成了接近人形的变异生物，也就诞生了新一代的忍者神龟，斯普林特开始训练这些乌龟们滨户良留下的忍者功夫和知识，希望有朝一日能为自己的主人复仇。2003年的某一天，已经长大并初露锋芒的忍者神龟们终于遇到了他们的宿敌，施莱德试图拉拢神龟之一的李奥纳多为自己服务，但是惨遭失败，露出邪恶本性的阿特姆施莱德与神龟们开始了第一战，最后在斯普林特出手帮助下众人合力将其击退。过了一段日子，施莱德展开了复仇，并将李奥打成重伤，在朋友帮助下逃过，休养生息后神龟们返回纽约与施莱德展开第二次较量，最终施莱德被李奥用腾古之剑砍下脑袋，但是我们知道这只是他的机器外壳，而神龟们的代价则是失去了他们的父亲:斯普林特的踪迹……为了寻找失踪的父亲，神龟们结识了阿特姆流亡者一族并且了解了他们的历史，但是就在这时，施莱德再度出现了，一番大战后，施莱德露出了他的真面目，眼见阿特姆一族利用传送门逃离地球，千年的复仇计划毁于一旦，施莱德气急败坏的要与神龟们同归于尽，而最终神龟们利用传送门逃生，施莱德则在一片爆炸声中消失了踪迹……
