主角秦尘本是武域中最顶尖的天才强者，却遭歹人暗算，陨落大陆禁地死亡峡谷。必死无疑的秦尘，却意外触发神秘古剑的力量……三百年后，天武大陆偏僻之地，一位同名少年意外继承了秦尘的意志。作为大齐国军神定武王的爱孙，却因生父来历成迷，母子二人在定武王府中受尽冷遇，相依为命。为了重写望日的强者神话，也为了守护自己所爱的一切，秦尘毅然决然扛起维护天下五国的大任，再度踏上武道之路。
这个星球被DS（达摩克里斯）科技军队占领，强AI（人工智能系统）是这个军队的首领。反抗AI和DS的鹰隼部队，对疯狗镇（DS试验场）进行肃清。原为疯狗镇电工却拥有既视感（短暂预测未来）的马三、神秘女子洛凝和改造人翎以及黑客小海一同反抗并逃亡。疯狗镇的主人（“神父”莫比）乘火箭逃离殖民星球，疯狗镇的众人即将被火箭烈焰活活烧死，马三为救众人连接了AI天眼卫星，成功阻止神父并和众人逃出了疯狗镇，这一举动暗示马三可能来自DS，马三也开始对既视感的来源产生怀疑？ 众人来到被一群末世难民占领的废弃驿站，这里的首领封子昂认出马三，称呼他为长官，随即自愿帮助马三找回记忆，但殊不知，这只是一场阴谋的前奏……
本季围绕王者大陆中的长安城，从新人云缨加入大理寺开始，她与李元芳携手执行任务，逐步揭开尧天组织的神秘面纱。尽管大理寺与尧天组织的成员们分属不同阵营，但他们都在以⾃⼰的⽅式守护着长安，追求着⼼中的正义。
《木奇灵2圣天灵种》是武汉博润通公司制作，心田动漫文化传播有限公司编剧的国产动画片。该动画片是一部乐趣科普片，是一部快乐成长史，是一个人与自然和谐共生的快乐王国，具有“植物、人文、连接、全产业、向世界”五大精髓，以深度融合共赢突破了动漫界限，与多领域伙伴一起创造一个涵括 文化、人文、科技、产业为一体的情感世界。 由于人类的扩张对水源造成破坏，最终导致海洋受到严重污染，海洋中的巨藻木奇灵摩天因为无法抵抗海洋污染的侵蚀，选择利用污染的黑暗元力开展报复计划，一种叫“赤华”的植物开始在人类世界和绿影岛上疯长，危机瞬间爆发。滨江之城的小学生洛飞、浩磊、凌天恒回到了绿影岛，和绿影岛的灵希公主以及他们的契约木奇灵一起寻找一颗传说中拥有强大净化能力的圣天灵种来应对赤华危机。当洛飞等人经过重重考验成功得到圣天灵种后，不仅要对抗摩天一方制造的麻烦，还要面对同伴之间的摩擦与误会，但洛飞没有退缩，带着伙伴们踏上前往深海之都的旅程，最后成功击败摩天，净化赤华，消除了危机。
