小新今年5岁了，不要以为他是那种懵懂无知的小孩，他其实人小鬼大，喜欢漂亮的姐姐，收养了一条棉花糖一样的流浪狗——小白，还经常讲些无厘头的黄色笑话。小新的妈妈美伢是一个全职主妇，粗心而又有点神经质的她经常被小新捉弄得七窍生烟，爸爸野原亦经常被这两母子搞得晕头转向。 《蜡笔小新》的作者以一个5岁小童的眼光，40岁的成年人的心态去观察这个大千世界，看到了许多光怪陆离的景象，小新一家的幽默故事亦由此产生。
此去经年，窟卢塔族惨遭灭族的伤痛依然时时折磨着最后的遗民酷拉皮卡（泽城美雪 配音）的身心。在追寻幻影旅团的旅途中，酷拉皮卡竟意外重逢当年的本族好友Bairo，谁知却被对方夺去了号称“七大美色”之一的绯红之眼。他的遭遇经雷欧力之口，很快传到了奇犽（伊濑茉莉也 配音）和小杰（潘惠美 配音）的耳中。为了找到伤害朋友的真正凶手，他们四处追查对方的藏身之地，在这一过程中结识了美丽神秘的少女小列，同时遭到一群死亡人偶的攻击。另一方面，西索（浪川大辅 配音）突然现身酷拉皮卡和雷欧力面前，向他们揭示了凶手的真实身份。盘根错节的恩怨，拉开了一场惨烈战斗的序幕…… 本片根据漫画家富樫义博的同名原作改编，为该动画的首部剧场版。
20XX年8月，东京的银座突然打开了‘门’（ゲート）并从中出现了大量的怪物及仿若中世纪欧洲的骑士组成的军队，杀死了大量的平民，后称此事件为“银座事件”。 在事件发生后的七天，击败敌方军队并顺利攻占异世界的‘门’的日本政府，称‘门’另一边的幻想世界为“特别地区”（简称“特区”)，同时为了调查及防止类似“银座事件”的情况再次发生而派出自卫队，确保‘门’的掌控。 在“银座事件”活跃的主角伊丹耀司（动机是“这样下去同人志贩卖会就要中止了！”），在事件后晋升为二等陆尉(为中尉军衔)，并率领一只侦察队深入“特区”，在为了调查遭炎龙毁灭的村子时结识并与三位美少女（魔法使、精灵、亚神）一起行动。 “银座事件”的当事人要求日本政府向“帝国”讨回赔偿，但对没有人权及国际法等概念的帝国交涉十分的困难。这时垂涎“特区”利益的世界各国也开始干涉自卫队在‘门’的另一边的行动。 ‘门’的另一边，自卫官不断与住在靠近自卫队的桥头堡的避难村民交流，日本（地球）的文化在“特区”逐渐的传播开来。
