ヒャッコクジムのジムリーダー・ゴジカに勝利し、7つ目のジムバッジを入手したサトシ達は8つ目のポケモンジムがある街・エイセツシティに向けて、旅を続けていた。その道中、一行は正体不明のポケモン「プニちゃん」を旅に連れていくのだが、「プニちゃん」は謎の集団・フレア団に狙われていた。 击败了第七道馆的道馆训练家葛吉花后，小智一行人继续以收集齐八枚徽章为目标向映雪市进发。在旅途中，他们遇到了正体不明的绿色生物“小软”（基格尔德·核心）及为其目标而行动的神秘团体“闪焰队”。
数千年后的未来，进入宇宙空间的人类， 被分为银河帝国与自由行星同盟这两个 拥有“专制政治”与“民主主义”两种不同政治体制的国家。 两国之间的抗争持续了150年， 以无边无际的广袤银河为舞台， 重复着无止境的战斗。 银河帝国的门阀贵族社会的腐败， 以及自由行星同盟可称为民主主义的弊端的群愚政治 侵蚀着两个国家。 之后，宇宙历8世纪末，两位天才的登场驱动了历史。 “常胜的天才”莱因哈特·冯·罗严克拉姆， 以及人称“不败的魔术师”的杨威利。 两人率领着帝国军与同盟军，展开了不知道是第几次的冲突。
故事发生在名为恩典农场的孤儿院内，在这里生活着很多失去了亲人，无家可归的孩子们，他们共有36人，每天，在劳作和玩耍之余，孩子们还要进行学习和测验，其中，佼佼者是名为艾玛（诸星堇 配音）的女孩和名为诺曼（内田真礼 配音）的男孩。负责管理和看护这些孩子们的女性名叫伊莎贝拉（甲斐田裕子 配音），孩子们喜欢喊她“妈妈”。每过一段时间，都会有一个孩子被收养离开农场，生活在这里的孩子们都将此作为自己的人生目标。 一次偶然中，艾玛发现了隐藏在这座孤儿院背后的秘密，那些离开的孩子根本就没有被领养，而是被屠宰了，生活在恩典农场的孩子们，其实就是这座农场所饲养的“牲畜”。
升上二年级的泽村荣纯，终于拿下了春季甲子园的入场资格！ 目标仅仅是全国制霸！！ 名校终于复活。青道高中棒球社的极速进击开始！！
通体雪白的鸭子先生（松野太纪 配音）有着帅气的卷毛，但其粗心脑残地毛病着实令人担忧。他住在一座热闹的大森林中，这里有丰富的水资源和茂密多样的植被，虽然充斥着狐狸、鹰、鳄鱼等恐怖的天敌，却是禽类赖以栖身的最佳场所。每天，鸭子先生漫无目的在森林中闲逛，他遇到过越冬的野鸭，并向他们学习飞翔的本领。也见识了冷言冷语的乌林鸮（小杉十郎太 配音）吓唬小鸟的情景。当然，还有号称善于捕鱼的绿鹭（下崎紘史 配音）、恋爱中却总是受挫的鸽子君、举止优雅的大白鹭（石嶋久仁子 配音）、对大白鹭崇拜得五体投地的小白鹭（良田麻美 配音）等形态和性格各异的可爱鸟类。充满乐趣的大森林，是鸭子先生的快乐家园…… 本片根据マツダユカ创作的四格漫画改编。
