在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
某小学五年级学生赵新新是个武侠迷，没事喜欢露两把刷子，不过他很不爱讲卫生，某天就因吃了脏东西闹肚子疼。站在公交车上捂着肚子回家时，赵新新做好事掏钱为一位咳嗽不止的老爷爷找了个座位，因此和这位自称怪老头的老爷爷认识，几句交谈，赵 新新感受到了怪老头的神奇。尔后，怪老头带赵新新来到他的家，一番表演又把赵新新看得目瞪口呆，突然，怪老头要赵新新吞下两只小鸟，好消灭他肚子里作怪的蛔虫，赵新新被吓个半死。
