上古时代，只身在空旷的原野中生活的女娲为了缓解孤独，用泥巴捏制出无数小人，小人们随后变作有生命的女人和男人，他们结合繁衍出后代，日子过得幸福快乐，女娲看着后代满足地进入梦乡。后来，火神和水神发生争执大打出手，一时间天地动摇，女娲的后代陷入水深火热之中，发出连连惨叫。 女娲被惨叫声惊醒后，立刻从腰际摘下一片绿叶抛掷水中，绿叶变作扁舟救下溺水的人儿。随着火水两神战斗的升级，更可怕的事情发生：天被他们撞出裂缝，滚滚落下的碎石砸伤了许多逃命的人儿。女娲见状，忙托起五彩巨石填补天上的一个个空洞，但风太猛烈，不待她填补完毕，裂缝已经扩大，女娲遂用自己的身体将天补好。在她修补过的地方，隐约出现闪闪发亮的星座。
自从上次蛇蛙大战后，蛙国又恢复了和平繁荣的生活。可是，和平的日子没持续多久，奇怪的事件又再降临青蛙王国。一张写着大祸即将降临青蛙王国的传单，散落在蛙国各地，关于“水晶青蛙”的传说正流传于民间。 水晶青蛙，护国神器，大难大祸将至，究竟青蛙王国会面临怎样的命运，青蛙勇士这次 又能否化解蛙国危机的再临呢？ 与此同时，逃婚的小雨点（孙楠 配音）与公主重遇，二人之间的关系变得十分紧张。在蛙国大难来临之前，他们又能否化解彼此内心的隔阂，牵手抵御灾难的降临。
