故事讲述哈小浪平静的校园生活被一场突如其来的流星雨打破了，一颗流星居然正面砸中了许愿中的哈小浪，被流星击中的哈小浪不仅毫发无损，还升级了超能力。人们在砸落的流星中找到了一些星状徽章的物体，对它进行许愿便能立马实现愿望，许多人纷纷开始找更多的星状徽章。这些神秘的徽章也引来了外星生物，原来这些徽章一直都是外星生物追寻的宝物，为了收集齐这些星徽，外星生物大肆入侵哈小浪的星球。面对强大的外星生物，哈小浪和他的小伙伴们化身为“星城守护者”，为保卫星球之战奉献出自己的一份力量。获得星徽的星狗们便能利用它召唤出专属自己的的圣甲，而星徽要是落在了外星生物手中便会引起巨大灾难，双方也陷入了十二星徽争夺战中。
基因石被毁，不料基因石能量逸出，飘散到地球各处，引发了异常现象，故事从变形机甲、机甲兽和变异战士三方之间的斗争展开。
新天眼将主线设定为孩子们在生活中所面临的一些问题，比如说成长、梦想、教育、环保等，整个故事情节十分贴近生活。天眼和好朋友们的一个个生活小故事中展现了许多善良诚实、积极乐观、团结友爱的中华民族优秀品质，让孩子们在观看多彩动画的同时还能汲取一些精神养料。
