神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
平凡的打工人裴谦意外绑定财富转换系统，给了他花钱经商，重来人生的好机会。然而系统规定盈利一百才挣一块，亏钱却能全落自己腰包。为了亏钱，裴谦选择了风险高，烧钱快的游戏行业，故意制作了一款款违背市场规律的“另类”游戏，却一次次意外走红，挣得盆满钵满，痛苦地成为了众人眼中崇拜的“商业奇才”，可只有裴谦心理清楚，我真的只想亏钱啊．..
白糖一行人经历了失去师傅的悲痛之后，他们将这种悲伤转化为力量，成功击败了邪恶的傀儡师。接着，他们踏上了前往小青（王晓彤 配音）故乡——身宗的旅程。身宗四面环海，风景如画，这里的星罗班一行人开始享受难得的宁静和美景。 然而，这段短暂的快乐很快被现实的无奈和艰辛取代。他们面对前所未有的困境，遇到更为强大的敌人，必须作出艰难的道德抉择和正义判断。在残酷的现实和邪恶敌人的磨砺下，星罗班和小青都开始进一步成长和改变。这段旅程不仅考验了他们的意志和能力，也逐渐揭示了小青身世的秘密，让他们的使命和目标变得更加清晰和紧迫。这个故事突显了主人公们在面对挑战和困难时的坚韧与成长，以及他们逐步揭示和理解自己身世秘密的过程。
霍雨浩结束交换生生活回到史莱克学院后，和贝贝、徐三石、和菜头等人一起参加了海神缘相亲大会，并在大会上与恢复女儿身的王冬儿相认定情。但没过多久，史莱克学院转来了一个和王冬儿长得一模一样的女孩——王秋儿。新一届全大陆高级魂师学院斗魂大赛在即，霍雨浩一行决定代表唐门出战。
