神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
鼬鼠、兔子、海狸、猫头鹰以及蜥蜴五个 主人公带着小观众们一起进行探险旅行， 传播野生动物知识，培养小朋友认识大自 然的兴趣。
马诺一行人为了寻找兰欣儿的爸爸兰博士，想要离开沙巴而经由塔鲁曼到达丛林的心脏砂拉越，他们在危险的塔鲁曼丛林里开启新的冒险旅程。
故事讲述了性格孤僻冷漠的主人公贝恩，来到异大陆后邂逅一群命运类似但性格炯异的战友们，发现新能源世界的各种阴谋，与之不断斗争和成长的故事。
