家族长老为争夺矿上开采权，派人碎他丹田，从此成为叶家弃子。然而他却因母亲流血的戒指意外进入界狱塔，得神秘人指点，修炼从未有人修炼过的剑道。叶家弃少叶玄：“我必须变得强大，那样才能保护妹妹，夺回我在叶家失去的一切。”神秘女子：“跟着我，我让你成为诸天界最强剑士。”在神秘女子的帮助下，叶玄能成为诸天界最强剑士吗？
故事延续第二季主线，灵界与斗魂卫在利益纠葛之下冲突不断，本季灵界派出强盛军队欲对斗魂卫赶尽杀绝，两方势力都在以正在举办门宗大会的五法山为中心汇集，在这里发生着惨烈的战斗与冲突。
桃夭带着小和尚磨牙、第一季收服的小狐妖、桃都老邻居柳公子一起，为了寻找失踪的百妖谱而云游四方。在途中遇到应声、化蛇、媪姬、照海四个妖怪，为妖怪治疗各种疑难杂症。
一个身怀绝技的少年，没能通过遴选走上修真者之路，就在他调整好心态，接受这一事实的时候，几颗神秘的骰子突然出现，他突然拥有了神奇的能力，被赋予重建神族的使命，少年的人生由此改变。一个深藏于心的秘密，一种叫大龟甲术的游戏，九颗神秘诡异的骰子，神之血脉的继承者，重建神族的使命。
故事依旧围绕斗龙战士的冒险、友爱、热血的战斗精神展开叙述，通过宝贝龙拍档和原始恐龙之间的经历和磨炼，以及斗龙战士之间的情感变化，多角度的弘扬斗龙精神，让孩子们体会成长中遇到的挫折和变化，让人类向原始恐龙学习来自原始恐龙世界的美德，共同为创建人类更美好的未来而努力。
在马兰山下，有一对孪生姐妹，大兰和小兰。大兰懒惰而整天与老猫玩耍，而小兰则因勤劳嫁给了山上的青年马郎，共同过着幸福的生活。然而，山上有只老狼一直渴望得到传说中的马兰花，为了过上不劳而获的生活。当小兰和马郎回家看望父母时，她们带来了丰富的礼物。大兰嫉妒之心油然而生，误会小兰头上戴的小花是传说中的神奇马兰花。大兰决定争取这朵花，以实现自己的愿望。 在老狼和老猫的怂恿下，大兰展开了一场争夺马兰花的行动。不幸的是，在这个过程中，由于大兰的贪婪和不顾后果，小兰不慎掉入河中。大兰意识到自己的错误，感到愧疚和内疚。当马郎出现时，大兰无奈地冒充小兰，一同登上马兰山。在这次冒险中，她经历了风吹雨打，历经千难万险，最终获得了传说中的马兰花。有了这朵神奇的花，她希望能够实现愿望，让妹妹“活过来”。
