《熊出没之探险日记2》则延续了上一季的剧情，除了保留大家最爱的女性角色赵琳外，还加入了人类大反派“天才威”等新角色，使剧集更具矛盾冲突。
五十年前，江湖突然被 “混沌”入侵，慕容穹组建魔教对抗，艰难苦战不得胜利。神使易枝花降临，教会众人妖化功法成功战胜混沌。可神使离开，妖化功法传入江湖后失控，慕容穹失望退隐。他的手下余化冰趁机上位，改良妖化功法，竟创造出朋克真气时代，让江湖欣欣向荣，但代价就是江湖客们都变成了“上功怪“”。有着赤子心的少年东方胜，找到了归隐在向西饭店的慕容穹，想靠他恢复昔日江湖荣光，啼笑皆非的故事自此拉开帷幕……
祁小智意外来到精灵世界，结识了精灵世界的好伙伴，有精灵猎人苏瑾、陆大班，活泼可爱精灵搭档火暴暴、金刚虎、水玄武，他们在冒险中不断学习和历练。但是，邪恶的力量不期而遇，正在破坏精灵世界的美好家园。他们团结一心，利用勇气、智慧和友情等精神力量，一起抵抗恶势力，守护精灵世界的安全与和平。
伍六七接到神秘任务过程中却意外丧失记忆，为了唤醒记忆，伍六七去到过往记忆发生的地方见到记忆相关的人，其身世之谜也随之逐渐浮出水面。
沈长君因为评论了一下小说剧情，阴差阳错间竟成为了作者原书中的师尊。为了在徒儿第九千夜面前树立一个光辉美好的师尊形象，沈长君开始了自己的完美计划……
