《小济公》以当代少年儿童的心理与视角，用动画独特的视觉语言，讲述了我国著名民间传奇人物济公小时候发挥聪明才智、怀揣正义和勇气来扶弱济贫、助人为乐的故事。片中的故事情节颇为有趣，引人深思，让观众们在潜移默化中领悟到做人做事的道理。
该片讲叙了虹猫、蓝兔在开心国的奇妙识字旅行。虹猫、蓝兔在一次野外识字游戏中，从一群蚂蚁手中救下了神奇的字魔方，他们得知字魔方要找回因蚂蚁国进攻而失散的字卡，决定帮助字魔方。一段寻字、识字的旅程开始了，开心国的小王子乐乐、蚂蚁国的小公主六六先后加入了虹猫、蓝兔的队伍。四个孩子克服了重重困难，终于找齐了以笔、墨、纸、砚四大字精灵为首的全部字卡。蚂蚁国也与开心国重修旧好，幸福和快乐又回到了这片土地上。
皮皮鲁抢走了缩小芯片，带舒克贝塔回家。为躲避捕鼠队，三人从皮皮鲁家逃至交易市场。捕鼠队继续追击到这里。朋友加西和琪琪等布置了防御措施，与强大的机械狗、无人机对抗，老鼠科学家也来抢夺芯片。 危急关头，皮皮鲁选择缩小加西、方猎猎等，大家共同商议如何对付白客公司。同时，白客公司开始转移实验室。舒克贝塔琪琪等开着飞机坦克和摩托车与白客公司交战，夺回了实验室。但恢复芯片却落入白客手中。皮皮鲁改造升级了装备帮助大家潜入。 舒克贝塔终于找到恢复芯片，却不幸被捕鼠队长抓住，在监狱见到了旧敌白路。原来他因放电功能被抓来做实验。
王胜于现代世界醒来，曾与之相伴的人依稀仍在左右，这究竟是一场梦，还是另一场天大的阴谋？
