在娱乐视听高度发达的当下，少女偶像不仅圆了许多人的梦，也令很多情窦初开的女孩找到人生前进的方向。小型艺能公司765事务所便云集了12位性格各异但拥有着共同梦想的女孩子，她们是天海春香（中村绘里子 配音）、星井美希（长谷川明子 配音）、如月千早（今井麻美 配音）、高槻やよい（仁后真耶子 配音）、萩原雪步（浅仓杏美 配音）、菊地真（平田宏美 配音）、双海亚美（下田麻美 配音）、双海真美（下田麻美 配音）、水濑伊织（钉宫理惠 配音）、三浦あずさ（たかはし智秋 配音）、四条贵音（原由实 配音）、我那霸响（沼仓爱美 配音）。事务所新人男性担任摄影师，跟踪记录下女孩们成长的每一天。曾经当过偶像的制作人秋月律子（若林直美 配音）则耐心引领着少女们一步步向偶像殿堂迈进。                                    
                               　　光明之路纵使充满坎坷，但没有人会拒绝品尝胜利果实的那一刻……

サマーフェスから1か月が過ぎた頃、346グループ会長の娘で、米国の関連企業から戻ったばかりの美城常務がアイドル部門の統括重役として赴任する。成果が上がるまでの時間がかかりすぎている346プロの現状を問題視する常務は、全プロジェクトを解体して白紙に戻し、有望なアイドルを見定めて彼女らを中心に据える346ブランドの強化案を実行に移した。フェス後に順調に仕事を増やしてきたCPも影響を受け、プロジェクトルームも30階のオフィスから地階へと移ることになる。画一化されたアイドルの理想像を提唱する常務に対し、アイドル各人の個性の成長を重視するプロデューサーは対案として「シンデレラの舞踏会」企画を提示し、今期末（冬）までに一定の成果を出すことを条件に自由裁量権を得る。                                    
                               　　強引な改革は346プロを徐々に変えていく。常務が有力なアイドルへの働きかけを続ける裏で、CPは「舞踏会」の為に更なるスキルアップに励み、その過程で常務の路線に難色を示す他部署のアイドルをも巻き込んでいく。やがて常務は自ら選抜したアイドル達で構成される新企画「Project:Krone」を発表するが、そのメンバー候補の中にはアナスタシアと凛も含まれていた。アナスタシアは自身の成長のためにあえて参加を決意し、その意を受けた美波と、CPの枠を越えてアイドル各人の将来を考え始めたプロデューサーの承認を受けて「LOVE LAIKA」との掛け持ち態勢に移る。一方、同じく「Krone」に選ばれた中学校時代の同級生・北条加蓮と、その相棒・神谷奈緒とのユニット「トライアドプリムス」に惹かれる「なにか」を感じた凛は卯月と未央に相談を持ちかける。未央は一度は「Krone」への参加に反発するが、凛が求めている「なにか」を自分なりに確かめるため、自分もソロ活動に挑戦することを宣言し、凛の背中を押す。                                    
                               　　常務から各部署の査定会を兼ねるオータムフェスに急遽参加を求められたプロデューサーは、他部署からの応援を加えてCPを再編成する。

　　故事发生在名为“346Production”的艺人事务所中，最近，事务所里退出了全新的偶像培养企划，工作人员们称之为“灰姑娘计划”。被选中的少女们不仅可以参加课程训练，更可以登上舞台，完成她们的偶像梦想。然而，这如同灰姑娘一般神奇美好的故事背后，却隐藏着无数的泪水和汗水。
　　总是笑容满满的元气少女岛村卯月（大桥彩香 配音）、外表冷静内心火热的涩谷凛（福原绫香 配音）、活泼开朗，总是给大家带来快乐的本田未央（原纱友里 配音）、个性率直天真烂漫的赤城米莉亚（黑泽朋世 配音），当聚光灯照耀在这些善良的女孩头顶之时，会发生怎样有趣的故事呢？

　　表面看来，藤原梦路（冈本信彦 配音）不过是一介平凡少年，然而，他却隐藏了一个不为人知的的秘密——每天夜晚，他都会遭到噩梦的纠缠，并且，梦路拥有能够预知他人梦境的特殊能力，能够通过观察人们周身所散发出的颜色来判断梦境，尽管准确率很低，但到底算是与众不同。
　　某日，梦路惊讶的发现，噩梦中的场景竟然蔓延到了现实之中，正当他处于惊恐之中手足无措时，一位名叫玛利（佐仓绫音 配音）的神秘少女出现并救了他，之后，外冷内热的天使安琪（远藤绫 配音）、天真烂漫的帕蒂（后藤沙绪里 配音）、邪恶腹黑的米斯特汀（矢作纱友里 配音）接连出现在了梦路的身边。

　　动画作品《Little Busters! EX》是Key社出品的游戏《Little Busters!》第三度动画化的作品，前两作分别是《Little Busters!》和《Little Busters! ～Refrain～》。动画将涉及原作游戏的追加版《Little Busters! Ecstasy》（リトルバスターズ! エクスタシー）中的剧情。

　　位于东京西部的巨大“学园都市”。在总人口达230万人，其中约8成是学生的这座都市中，实施着超能力开发的特殊课程，学生们的能力被给予从“无能力Level 0”到“超能力Level 5”的六阶段评价。
　　高中生上条当麻，也是住在学园都市的学生之一。他由于隐藏在右手中的力量——只要是异能之力，就连神的加护都能消除的“幻想杀手Imagine Breaker”，而被评价为名落孙山的“无能力”，过着充满不幸的人生。
　　而上条的学生生活，由于暑假开始时从天而降的纯白修女而发生了巨大的变化。自从与逃离“魔法”世界的她——“禁书目录茵蒂克丝”相遇开始，上条就被卷入了各种各样的事件中。统率学园都市的“科学”方、与茵蒂克丝关联的“魔法”方，在惊险地解决双方事件的过程中，他的人际关系也逐步扩展。之后，魔法一方的十字教最大宗派罗马正教，终于注意到上条的存在……。
　　如同呼应魔法方一般，科学方的学园都市也有所动作。但也有与逐渐开始对立的世界动向抗争的人不断出现。那些通过与上条有所关联，而使命运大为改变的“英雄”们。
　　他们挺身而出与世界对峙。如同上条当麻做过的那样。
　　科学与魔法第三次交织之时，故事将大幅推进！！

　　幼时曾深陷绝望深渊的直枝理树，与4位少年少女相遇了。                                    
                               　　在那之后数年，理树作为Little Busters的一员，喧闹地过着快乐的每一天。                                    
                               　　这样的时间能够一直持续就好了。理树所期望的只有这样。                                    
                               　　某日，恭介突然表示要成立一支棒球队伍，                                    
                               　　理树则开始了寻找成员的任务。                                    
                               　　在这样的过程中，理树邂逅了新的成员们。                                    
                               　　和大家一起参加试胆大会，潜入女生宿舍时被换上女装，一起演人偶剧……。                                    
                               　　经历了许多快乐的事情，                                    
                               　　同时也在大家的帮助下解决了各自拥有的烦恼。                                    
                               　　最后在棒球比赛中，理树确认了和最好的朋友们之间的牵绊。                                    
                               　　——然而，这并不是结束。                                    
                               　　和来谷唯湖之间的故事。                                    
                               　　理树与铃的故事。                                    
                               　　以及，理树和铃终于知晓的“世界的秘密”。                                    
                               　　Little Busters真正的物语，自此开始——。