跟着墨菲家的脚步，回到那个孩子们恣意游荡，纵情畅饮啤酒，男人和电视形影不离的 1970 年代。
“这里……是哪儿……” 察觉到的时候，桐人不知为什么陷入了庞大的幻想风格虚拟世界。登录前的记忆模糊不清，只得在周围徘徊寻找线索。 之后，来到漆黑的巨树“基家斯西达”旁边的他，同一名少年相遇了。“我的名字是尤吉欧。请多关照，桐人君。”少年是在虚拟世界的居民――即“NPC”，但是却如同人类一样拥有“丰富感情”。 在和尤吉欧加深交往的同时，桐人也在摸索着登出这个世界的方法。在桐人的脑海中，某一个记忆苏醒了。那是幼年时的桐人和尤吉欧在山野奔跑的记忆――原本，不可能存在的记忆。而在那个回忆中，除了尤吉欧还有一个金发少女的身影。她的名字，是爱丽丝。绝对不应该忘记的、重要的名字。
男孩子气的女高中生相泽智向初中前一直把自己当成男生的青梅竹马久保田淳一郎表白，却收到了“我也爱你！挚友！”的回答。想要被喜欢的男生当成“女孩子”看待！“男孩子气女生”校园爱情喜剧，开幕！
在经过七个特异点的大战后，人理存续保障机关迦勒底，终于到达了圣杯探索的最终地点——终局特异点 冠位时间神殿所罗门。他们要击败身为罪魁祸首的魔术王所罗门，夺回未来。在开战的前一刻，一行人各自度过了一段时光。罗马尼·阿其曼思索起自己将要做出的选择，以及玛修那即将迎来终点的生命。而即将投身最后一战的藤丸，正在试穿全新的礼装。为了迄今为止的诸多相遇，以及从今往后的诸多未来，藤丸和玛修踏上了最后的战场。
在莉莉安女子学园，有一个传统，被称为该sœur系统（sœur在法文中解作“姊妹”），其中二或三年级的学生会给予一个低年级生一串念珠，而低年级生就会成为她的妹妹，身为姊姊的高年级生须承诺会照顾妹妹，并教导他们。 当故事开始时，福泽祐巳像其他学生一样在学校入口附近的圣母玛利亚雕像祈祷之后，遇到二年级生小笠原祥子，祥子只是轻轻走近帮祐巳整理丝带。这看似简单的行为，被祐巳的朋友茑子拍下，茑子为了可以在学园祭上登出这张照片，在那天放学后强行拉祐巳到蔷薇之馆。不过祐巳在蔷薇之馆的会议室门口被正要冲出来的祥子撞个正著，祥子见到祐巳，就要求她当自己的妹妹。原来祥子被要求在学园祭上的话剧当女主角，但由于祥子十分讨厌男生，所以不愿参与演出，祥子的姊姊说：“没有妹妹的人没资格发表意见。”祥子巧遇祐巳，正好有了妹妹的理想人选。祐巳一开始认为自己没有资格担入祥子的妹妹，可是经历了几件事之后，二人终于打破障碍，成为姊妹。 后来祐巳就在山百合会帮忙，协助蔷薇大人们处理学生会的事宜，并和岛津由乃和藤堂志摩子成为好友。透过情人节和毕业典礼等活动，在圣母玛利亚的面前，大家成为好友。玛利亚的凝望的故事，就是围绕着山百合会的女孩们的小故事。
