西元2199年，来自太阳系外的敌人加米拉斯帝国，为了挽救母星的危亡，开始侵略其他星球。地球军在与加米拉斯帝国军的交战中惨败，同时加米拉斯帝国军向地球发射大量含有放射能的游星炸弹。地球的抵抗力量越来越弱。本与加米拉斯为双子星球的伊斯坎达尔星球仗义相助，向地球发送了波动引擎和波动炮的设计图纸，并告知地球军本星球拥有清除放射能的设备“宇宙清洗器D”。在与欧洲、美洲失去联系的情况下，地球防卫军利用伊斯坎达尔星球提供的技术将沉睡于海底的大和号改造为宇宙战舰。大和号全体乘员踏上了取回“宇宙清洗器D”的漫漫征程。
本作是在教育节目《和姐姐唱歌吧！》中负责唱歌的大姐姐高崎三奈美，和想要成为绘本作家的单身父亲藤本翔二之间的恋爱故事。在一天翔二和女儿在家庭餐厅遇到了喝闷酒的三奈美。在得知了三奈美的寂寞后，翔二开始将她作为异性对待。
某天突然出现了一个神奇的按钮。按下按钮后，就转移到了另外一个异世界！！ 从其他世界转移而来的角色们在那里大集合……！？
本以为战斗可以平息下来的真神学园"打鬼部"的成员们,没想到迎接他们的将是更加惨烈的战斗,"九角天童"背后的神秘人物终于在"拳武篇"中现身,这个给予"九角天童"邪恶力量的人究竟是怎样的,还有等待"龙麻、京一"等人的星宿的宿命又是怎样的,种种的谜团都将在"东京魔人学园剑风帖 拳武篇"中得到解答
本片改编自TYPE-MOON出品的文字冒险类游戏《Fate/stay night》，是该游戏最终路线“HF线”动画剧场版全三部作品中的第二章。通过女主角间桐樱的视角，讲述了御主和英灵为了得到可以实现一切愿望的圣杯而相互厮杀的一场战争。 时隔10年在冬木市爆发的这场“圣杯战争”中，因被称为“圣杯战争”御三家之一的间桐家的当家·间桐脏砚的参战而变得更畸形、扭曲和恶化。作为御主参战的卫宫士郎也在战斗中负伤还失去了英灵Saber，尽管如此士郎为了守护间桐樱，并没有从战斗中引身退出。而担心士郎身体的樱，自己也无法逃离魔法师的宿命……
