平凡的中学二年级少年影山茂夫，因其微弱的存在感而遭人戏称为“路人”，但不起眼的他其实是强大的天生超能力者。
故事发生在位于海德星系的马汀行星之上，在这里，人类建造了大型宇宙殖民地，过着平静幸福的生活。然而，一场意料之外的爆炸令亚维人类帝国舰队找到了入侵的途径，他们占领了殖民地，成为了这里的统治者。 洛克是马汀政府的主席，为了保一己之身，他不惜出卖同胞，换来了在新帝国之中的位高权重，成为了海德伯爵。一晃眼就是七年过去，杰特（今井由香 配音）是洛克的儿子，为了继承父亲的爵位，他来到了帝都，进入学校接收星界军的翔士教育，途中，杰特结识了名为拉斐尔（川澄绫子 配音）的女子，两人结为了好友。没过多久，人类统合体舰队发动了起义，四国联起手来，要夺回他们被占领的土地。
AR技術の発展によるMR－ミックスド・リアリティ－システムが普及した近未来。 社会のインフラに浸透したMRシステムは、新しいスポーツを生み出した。 その名もサークレット・バウト！ 女子高生の人気スポーツとなったサークレット・バウトは、やがて、 学園だけでなく地域を巻き込むエンターテイメントに急成長、 スター選手は国民的人気者になるほどの盛り上がりを見せるなか、 かつての強豪、今は弱小の聖ユニオン学園に一人の転校生が現れた。 和歌山の山奥からやってきた彼女の名前は、佐々木優佳。 果たして、優佳は聖ユニオン学園の救世主になれるのか！？
故事的主人公露恩·芭洛特是生活在马杜克市的未成年妓女。 经营着赌场的野心家榭尔捡到了无依无靠的她之后，给予了芭洛特一切。虚假的出身、虚假的过去和现实，彻头彻尾的简直像要重新书写一个人的人格一样。芭洛特学会了把自己的心封闭在壳里，渐渐的习惯了日复一日封闭自己的生活。 芭洛特明知道自己应该感激给予自己一切的榭尔，却又忍不住想知道自己是谁。一旦想起悲惨的过去，却只能感激现在的一切。有一次，芭洛特忍不住用计算机搜索到了自己的经历。这一次的过错，改变了她的人生。榭尔在知道了她的举动之后，决定将她烧死。 芭洛特在死亡线上挣扎了一圈之后终于保住性命。马杜克市事件的负责人乌夫库克博士将她全身的皮肤用强化纤维再造，使她活了过来。然而她却不得不面临新的选择，马杜克市有一个法令，以保护人命为目的的紧急法令——马杜克紧急法令09：使用法令禁止的科学技术所特别许可的特殊能力。芭洛特是否能得到这种能力，她又将如何生存下去？她的存在价值，她被杀的原因，她将直面这一切残酷的事实。
个性活泼开朗有时候显得有些大大咧咧的水无月遥（田村由加莉 配音）、成熟稳重颇具大小姐风范的神无月葵（能登麻美子 配音）、从意大利转学而来的天才少女叶月胡桃（钉宫理惠 配音），活泼可爱的三人平日里在学校中是无话不谈的好友，过着平凡的校园生活，但每当夜晚来临，她们便会变身成为拥有超能力的魔法少女。 三人的目标，是寻找价值连城的天使像，邪恶而又贪婪的地下拍卖组织Black auction得到了它，企图通过它来牟取暴利。成绩优异的学生会长如月唯人（桧山修之 配音）、随叫随到的万能管家长月平之丞（清川元梦 配音），是他们在背后默默的支持着少女们。
