完結編では、原作漫画の「忍舞市旅行エピソード」も描かれるぞ！ 忍舞市に集合した斉木たちを襲う災難とは…!? 更にメインビジュアルに空助と鳥束とねこ戦車が登場！ いつもの「澄んだ目をした煩悩だらけのエロ霊能力者・鳥束」の様子が何だかおかしい…？ 空助と鳥束の関係とは…！？
故事发生在樱丘高中内，在开学典礼上，合田美樱（丰崎爱生 配音）和芹泽春晖（铃村健一 配音）相遇了。四散的樱花雨中，两人的身影在彼此的眼中留下了深深的烙印。之后，姻缘的红线将两人紧紧的联系在一起，他们一起上学放学，一起吃午餐便当，在天台上闲聊打发时光，虽然周围的朋友们都认为两人已经是在交往的情侣了，但只有他们两人自己知道，在两人之间，依然存在着无法跨越的鸿沟。 美樱是美术部的成员，在画画时往往沉浸在自己的世界中无法自拔。而春晖则加入了电影研究部，个性开朗乐观的他喜欢和朋友们聚在一起讨论当下最流行的电影。这个世界上存在着相互喜欢但无法表白心意的人吗？
住人公是一个名叫饭冢和人的中学生，除了酷爱动画片他与别的少年没有丝毫不同。某个雨天，和人的注意力给一只被遗弃的可爱"小狗"吸引了，幸好得到一个言行举止怪异的少女七濑成惠(父亲是到地球侦查的外星人，母亲侧是地球人的星际混血儿七濑成惠，由于出身特殊，成长过程的14年的中一直过着没有朋友的生活，)及时出手相救才幸免被外星怪物所伤，于是开始了他们的交往生活。后来饭冢和人才意外发现成惠是个在地球上长大的外星人。她拥有瞬间移动的特殊能力。第一次的约会，和人在丸尾的指导和跟踪下开始行动。虽然事情的进展和丸尾所说的有极大的差别，但在和人的努力下最后还是赢得了成惠开朗的笑容。随着感情的上升，成惠要求到和人的家里，这使得他大为惊喜。可惜不幸被成惠看到他的成人刊物，在匆忙扯开话题后二人开始看动画片，感觉到很开心的成惠对和人送了一份特别的礼物。以七濑成惠与饭冢和人两人为主轴的恋爱故事，就此展开了…
故事发生在架空校园的一个活动室之中，放课后的学生们聚集在一起，就一些虽然平常但又的确引起了困扰的问题展开激烈的讨论。自大的学生会长高千穗千珐（川庄美雪 配音），黄毛不良少年宏哥（阿座上洋平 配音），外形是小兔的理科男兔子（照井春佳 配音），出生于医学世家的黑田君（荒井聡太 配音）等，这些长相和性格各异的同学们能够在学级活动的讨论中达成统一的意见吗？ 虽然每集动画只有短短的5分钟，但例如“为什么在学校里不能用那个？”、“为什么老妈总在讨厌的时间里进入房间？”、“如何称呼自己的母亲？”等类似的问题，却在讨论的过程中变得越来越严肃。而作为观众，也会在不知不觉中对于这些其实非常无聊的问题变得在意起来。
高中毕业后，因为游泳而互相牵绊的遥等人朝着不同的方向前进。遥在东京，与曾经一同游过接力的椎名旭相遇了。唤醒了中学时代记忆的遥，心中苏醒的是“那时”的郁弥的身影。 和遥一起前往东京的真琴，开始朝着新的梦想前进。来到悉尼的凛，在新的天地实现了意外的相遇。 在各自的未来中等待着他们的，是新的战斗吧。还是，与残留的过去的记忆对峙……？ 小学生、初中生、高中生——然后是大学生。遥和朋友们在水中编织出的关于友情和青春的故事在《Free!-Dive to the Future-》中相互交融！
